整个云南都为杨畏知的死而抱憾。无论贼兵还是百姓都偷偷流泪默哀，甚至还有人私下议论说：“杀却擎天柱，大事去矣。”孙可望此时算过账来，也有些后悔，反倒责怪左右不为杨畏知出言求情。杨畏知此人自从和孙可望等人约好“共尊朝廷，保全云贵生命”而降于大西军一来，赞画军政要事颇为卖力。可以说没有杨畏知就不会有云南以及大西军的今天，是杨畏知给大西军指定了长期规划，并参与了云南的建设。数年以来，政绩斐然。就是这样的人物，因为一言不合照样被孙可望所杀，那么还有谁是不能杀的呢？李定国和刘文秀收拾了杨畏知的尸体，安葬完毕，见孙可望如此残暴薄情，都开始有些不满孙可望的强横不臣，以及为自己的未来担忧。

　　永历五年（1651年）九月，清军孔有德部的广西固山线国安攻破梧州，而陈邦传竟然投降了清军。永历帝手头无兵，只有召群臣商议移跸。可是此时又能去哪里呢？有的大臣说应该逃到海上去，学习鲁王政权；有的大臣说应该去云南投奔大西军；有的大臣说要跑到交趾去，出奔国外；甚至有的大臣说可以去投奔“同姓”的延平王郑成功。一时间再次人心惶惶，各种意见五花八门，诸臣议论不一，纷然盈庭。此时，庞天寿和马吉翔因为和贺九仪有密约，将众臣的意见一概无视，坚决要求永历朝廷移跸入黔。

　　就在这时候，贺九仪又跑到了朝中大声吆喝：“原来秦王想请圣驾移跸滇黔，特命我来朝中扈驾，现在你们这些大臣既然怀疑我们，甚至还有别的打算，我哪里敢独自担当如此大任？”而且第二天一早，贺九仪就带着部下拔营而去。永历帝派官员拿着诏书挽留贺九仪一伙在朝中继续留下来，而贺九仪根本不加理睬。
　　日期：2014-11-19 16:13:08
　　此时永历朝廷无可倚恃，就连孙可望派来的贺九仪也拔营而去。而且理由也莫名其妙，还很不给永历帝朱由榔面子，说走就走，连圣旨都不予理睬。永历帝朱由榔非常不高兴，认为孙可望没有人臣的礼节，开始打算想别的方法躲避清军给自己争口气，又不打算去云贵了。可是众臣商议来商议去，只有两种办法，一种是南阳候李元胤提出模仿鲁王政权去海上漂泊，再寻找机会进取；一种是马吉翔等人要求还是去滇黔投靠大西军。永历帝本来想争口气，可是真要去海上漂泊，那也没什么把握。就是跑到郑成功那里，人家也未必给什么好脸色看。外加庞天寿和马吉翔听说永历帝又不打算去云贵了，担心和大西军秘密约定的事情大成不了，被永历帝翻脸责问倒是小事，被大西军知道那就不是闹着玩的了。两人就半哄半骗半威胁的要求永历帝一定要去云贵，舍此无处可依。其他大臣本来就没有什么好主意，朝中大权又掌握在马吉翔、庞天寿等人手中，怎么也扳不过马吉翔一党。于是，半推半就的形成了还是移跸滇黔的决议。

　　永历帝虽然心有不甘，但是手下这群大臣不但没有更好的提议，反而有很多人向着马吉翔说话，朱由榔知道自己也奈何不了庞天寿、马吉翔一党，只有默认去滇黔的方案。
　　永历五年（1651年）十一月，永历朝廷从濑江发船躲避清军，此时清军的追兵在后面相距只有五十里左右。到驻濑滩之后，马吉翔请永历帝及众大臣弃船从陆地前行，尽数弃去辎重，兼程而行。此时清军已过新宁，从陆路追袭，形势十分凶险。随着永历帝的众臣有本事在一片混乱中能上得了岸的人，才能追上永历帝的车驾，继续跟着大部队逃命。很多跟不上队伍的就四散而去，各安天命。就是皇嫂桂恭王妃也失去踪迹。永历帝此时差点都自身难保，哪里还有那工夫去顾及他人?只待远离清军的追赶之后，或许才能顾得上皇家的威仪和体面。

　　永历帝朱由榔的车驾，从土司安平、下雷归一路进发，途经各地土司蛮族都准备粮饷和夫役以供使用。而清军线国安部以精兵在后紧追，甚至线国安所率骑兵溅起的尘土都掩过永历帝的车驾，永历帝君臣相顾失色。
　　此时永历帝入逻江地界不过三十里，线国安一路急追，问路边的老人：“永历皇帝在哪？你看见过没？”老人回答：“看见被逻江土官迎入土司去了。”线国安又问：“离这儿有多远？”老人说：“只有半天的路程，但山势险峻路又狭窄，恐怕不够人马通行。”老人说完就走入密林之中。线国安这是看看日沉西山，就传令在此扎营。和线国安一起来的马雄问线国安：“永历皇帝相去不过三十里，为什么不追？”线国安回答说：“我只是奉命攻取南宁，并没有接到命令要去攻取土司，倘若连夜追赶永历皇帝，万一有个闪失，谁来担这个责任？”马雄连连称是，就和线国安一起引兵回了南宁。

　　永历皇帝和一起陪着逃难的臣僚们一夜都惊魂未定，直到第二天有老百姓前来报信说：清军已走，方才稍稍安心。
　　永历帝一行从逻江到龙英，遇到孙可望派来迎驾的天威营高文贵，外后营狄三品以及陈国龙。这三人给了永历帝随行官员一封信：“南宁如不守，当如安隆。”然后就去剿杀归附明室的土司去了。（这三人带兵将各处百姓杀得积尸遍野，惨不忍睹。）永历帝一行已经走到这里了，只有按照孙可望的吩咐去安隆。直到快年底，永历帝一行到达广南，由于土官侬治用输送进贡，狼狈不堪的永历帝君臣才勉强获得些接济。

　　此时李定国率其所部兵马近十万出靖州，孙可望怕李定国拥扈朝廷东向朝南，让冯双礼、马进忠带着五万兵马与李定国部同行，暗中监视掣肘李定国。又派郑国去监视永历帝行踪，以防李定国奉迎朝廷反而去了湖南。

　　永历帝及随行官僚、宫眷等人开始缓缓向安隆进发，一路上山路崎岖，只有沿途土司供给粮饷以敷使用。从广南出发时的君臣家眷等共三万人左右，在前往安隆的路上因为逃亡、病故以及各种意外事故，到达安隆时总人数还不达万人，可见沿途生活之艰辛以及道路险峻非常，很多人还没到达安隆就逃散而去。很多人冻饿而死，甚至有的人沿途又被孙可望的手下杀害。其实最惨的是永历帝朱由榔，明知孙可望凶狠残暴不下当年的张献忠，此去滇黔凶吉未卜，更像是摆脱了清军的追赶反而又陷入了大西军的圈套之中。从南宁到广南，再从广南到安隆，这一路上永历帝朱由榔历尽艰辛，其本意就算不想再去安隆，可是也没有办法。

　　因为马吉翔和庞天朔以及贺九仪已经有密约，再加上孙可望派来的郑国带兵前来监视永历帝一行，永历帝基本是被挟持而行，又要躲避清军紧趋其后的危险，又要担心残暴的大西军相随身边，还要以皇帝的仪态去管理和照料跟着逃命的从亡诸臣。明知安隆就算是个火坑，也只能硬着头皮跳进去。
　　日期：2014-11-25 18:00:29
　　永历五年（1651年）十一月到广南之后，永历帝一行直到永历六年（1652年）才逐渐到达安隆。在此之前孙可望却命令在昆明的王应龙营造王宫，以符合其秦王的地位和身份。王宫全部使用黄瓦遮盖，还特意拆来呈贡县的城墙砖石作为墙角，宽约六尺左右，以求坚固耐用。门外设通政司，立下马牌。还按照天子的仪仗，殿悬五龙，设螭壁。另外还特意选了些嗓门大，声音洪亮之人作为鸿胪寺赞礼。这些都已经明显超出了秦王所应该拥有的礼制和规格，从此可以明显看出孙可望显然有想僭称天子的想法。而孙可望此前已经自称“国主”，现在受封秦王之后，更加丝毫不掩饰自己的野心。